灵芝是用来增强免疫力的，而牛樟芝也是增强免疫力的，于是就有许多人把樟芝误认为成灵芝的一种，事实上两者并不同种。
樟芝的学名为Antrodia camphorata，灵芝的学名为Ganoderma lucidium；从外型来看樟芝呈平板状或钟乳状态，不规则且多变化，无柄，紧贴着牛樟树内壁心材表面生长，灵芝呈伞状，有柄，菌伞有光泽，伞下附有孢子，多生长在枯木外侧。
以最重要的三萜类来说，而单一品种的牛樟芝即有200多种三萜类，单一品种的灵芝只有20-50种三帖类，不同品种的灵芝总合才达200多种三帖类；牛樟芝气芳香，味辛苦，三萜类含量10-45%，灵芝味道苦，三萜类含量1-3%，牛樟芝具有抗癌保肝，解酒解毒，清热消炎，改善过敏体质，抗氧化，增强人体免疫力，辅助治疗肝炎，肝硬化等功效。而灵芝的主要功效为镇静，镇痛，镇咳，保肝，增强人体免疫能力；要判断樟芝是否好坏不是用多糖体的含量而是要用“马偕一号”三萜类的含量。而灵芝是用多糖体的含量。
因此牛樟芝又被称作为灵芝王，由于牛樟菇生长速度缓慢，寄生专一性，较不易以人工培育出子实体，所以，更加凸显出牛樟芝的珍贵。
牛樟芝是台湾特有的药用菌菇，1990年由大陆著名的真菌植物研究所教授臧穆与台北医学大学博士苏庆华共同发表宣告牛樟芝为灵芝科真菌中得新种（樟灵芝），1995年由台湾行政院农委会的张东柱博与周文能先生根据牛樟芝的形态特性，对牛樟芝的种名进行第二次修正，将牛樟芝归为（多孔菌科薄孔菌类），经科学研究发现其具 有很好的医疗功效，对身体机能具有功效性的机能性成分，因数量稀少且珍贵，被台湾各界持续关注并积极投入研究，使得牛樟芝的高经济价值得到充分发挥。